Elämän molekulaariset säätelyverkostot - R'Life (2020-2023)
R’Life selvittää, miten erilaiset mekanismit luovat kontakteja eliöiden genomin eri osien ja geeniverkostojen välille ja miten nämä yhteydet ohjaavat elämän toimintoja. Ohjelma tuottaa tietoa solujen, kudosten, solukkojen ja yksilön toimintaa ohjaavista säätelyverkostoista.
Elämän molekulaariset säätelyverkostot -ohjelman tavoitteena on ymmärtää laajempia kokonaisuuksia genomin toiminnasta ja sen rakenteesta. Ohjelma lisää tietoa siitä, miten erilaiset mekanismit luovat kontakteja genomin eri osien ja geeniverkostojen välille, ja miten nämä yhteydet ohjaavat elämän toimintoja. Miten yksilölliset erot esimerkiksi genomeissa vaikuttavat elimistön adaptaatioon akuutissa ja kroonisessa stressissä? Entä mitä silloin tapahtuu organismissa sisäisten molekulaaristen mekanismien tasolla? Miten genomin ja ympäristötekijöiden vuorovaikutusmekanismit vaikuttavat ilmiasuun?
Elämän molekulaariset säätelyverkostot (R'Life) -haun hankkeet valittu
Suomen Akatemia on valinnut seitsemän tutkimuskonsortiota (21 osahanketta) rahoitettaviksi elämän molekulaariset säätelyverkostot (R’Life) -akatemiaohjelmassa. Konsortioille myönnettiin yhteensä kuusi miljoonaa euroa nelivuotisiin projekteihin.
Perustutkimusta korostava akatemiaohjelma tuottaa merkittävää ja kokonaisvaltaista tietoa solujen, kudosten, solukkojen ja yksilön toimintaa ohjaavista säätelyverkostoista. Tämä kokonaisvaltainen tieto saavutetaan yhdistämällä uusia molekyylibiologian ja bioinformatiikan työkaluja. Säätelyverkostojen tutkimisen mahdollistaa vahva kehitys genominlaajuisissa, eri informaatiotasoihin pureutuvissa tutkimusmenetelmissä.
Ohjelma rohkaisee ja edistää sekä uusien tutkimusmenetelmien käyttöönottoa että uudenlaisia tieteellisiä lähestymistapoja suomalaisessa tiedeyhteisössä ja uudistaa näin merkittävällä tavalla alan tutkimusta. Ohjelmassa toteutuu eri alojen tutkijoiden tiivis yhteistyö, joka mahdollistaa erilaiset uudet näkökulmat ja ilmiöiden laajemman tarkastelun tuloksena mahdolliset tieteelliset läpimurrot merkittävissä biologisissa peruskysymyksissä. Tavoitteena on myös kiinnittää huomiota jo olemassa olevien tutkimusinfrastruktuurien tarjoamiin mahdollisuuksiin.
Ohjelman tavoitteet
- R'Life-ohjelmassa tavoitellaan laajaa ymmärrystä eliöiden säätelyverkostoista yksittäisten molekulaaristen muutosten sijaan.
- Ohjelmassa tuotetaan uutta tietoa merkittävistä säätelymekanismeista solu-, yksilö- ja/tai populaatiotasolla hyödyntämällä uusia molekyylibiologian menetelmiä.
- Ohjelma edistää uusimpien tutkimusmenetelmien käyttöönottoa, jo olemassa olevien tutkimusinfrastruktuurien tehokasta hyödyntämistä ja eri asiantuntijatahojen yhteistyötä.
Materiaalit
Hankkeet
Elämän molekulaariset säätelyverkostot -akatemiaohjelman haussa 2019 rahoitetut hankkeet (8M€)
R’Life 2019 konsortiot, kutsuhaku
Rahoituskausi 2020-2023, rahoitus 6M€. Linkki rahoituspäätöksiin
AdaGe: Genomirakenteen ja aineenvaihduntaverkon vuorovaikutus adaptaatiossa
- Paula Jouhten, VTT OY
- Ville Mustonen, Helsingin yliopisto
- H. Jussi Sakari Jäntti, VTT OY
- Esa Pitkänen, Helsingin yliopisto
- Hankekuvaus (pdf)
FateLevels: Soluidentiteettiä ohjaavat elämän säätelyverkot
- Pekka A. Katajisto, Helsingin yliopisto
- Maria Vartiainen, Helsingin yliopisto
- Ville Paavilainen, Helsingin yliopisto
- Hankekuvaus (pdf)
LincReg: LincRNAn johtamat ihmisen immuunivastetta ohjaavat molekylääriset säätelyverkostot
- Riitta Lahesmaa, Turun yliopisto
- Laura Elo, Turun yliopisto
- Hankekuvaus (pdf)
ELMI: Leukemian soluväliaineen tutkimuksella uusia markkereita ja terapiakohteita akuutin myelooisen leukemian hoitoon
- Taina Pihlajaniemi, Oulun yliopisto
- Valerio Izzi, Oulun yliopisto
- Jyrki Heino, Turun yliopisto
- Hankekuvaus (pdf)
CROSSHARES (xHARES): Perimien yhteensopivuus lajirajaa ylläpitävänä mekanismina
- Jaakko Pohjoismäki, Itä-Suomen yliopisto
- Eric Dufour, Tampereen yliopisto
- Hankekuvaus (pdf)
FOREVER: Geeniekspression säätely metsäpuiden evoluutiossa
- Tanja Pyhäjärvi, Oulun yliopisto
- Mikko Sillanpää, Oulun yliopisto
- Katri Kärkkäinen, LUKE
- Jarkko Salojärvi, Helsingin yliopisto
- Hankekuvaus (pdf)
NucleoMech: Solun erilaistumisen säätely tumamekaniikan kautta - kantasoluista syöpään
- Sara Wickström, Helsingin yliopisto
- Johanna Ivaska, Tampereen yliopisto
- Antti Mäkitie, Helsingin yliopisto
- Hankekuvaus (pdf)
Haku Akatemian rahoitusta jo saaville tutkijoille
Rahoituskausi 2020-2022, rahoitus 2M€. Linkki rahoituspäätöksiin
U12-tyypin silmukointikoneiston säätelyverkkojen tutkiminen genominlaajuisen datan integraatiolla
- Mikko Frilander, Helsingin yliopisto
- Hankekuvaus (pdf)
- Seminaariesitys 27.11.2020 (pdf)
Ilmastosopeutumisen geeniverkostot
- Timo Hytönen, Helsingin yliopisto
- Hankekuvaus (pdf)
- Seminaariesitys 27.11.2020 (pdf)
Sileiden lihassolujen ja fibroblastien kirjo valtimonkovettumataudissa
- Minna Kaikkonen-Määttä, Itä-Suomen yliopisto
- Hankekuvaus (pdf)
- Seminaariesitys 27.11.2020 (pdf)
Kohti hedelmöittymisen ja seksuaalivalinnan molekyylitason ymmärtämistä
- Jukka Kekäläinen, Itä-Suomen yliopisto
- Hankekuvaus (pdf)
- Seminaariesitys 27.11.2020 (pdf)
Uusi perhetaustainen sekvensointimenetelmä ja säätelyverkostojen selvittäminen väri-polymorfian taustalla
- Johanna Mappes, Jyväskylän yliopisto
- Hankekuvaus (pdf)
- Seminaariesitys 27.11.2020 (pdf)
Yksisoluanalyysit valottavat sikiökautisten valkosolujen liikenteeseen vaikuttavia mekanismeja
- Pia Rantakari, Turun yliopisto
- Hankekuvaus (pdf)
- Seminaariesitys 27.11.2020 (pdf)
Proto-onkogeeni Myc:n olennaisten kohdegeenien tunnistaminen
- Jussi Taipale, Helsingin yliopisto
- Hankekuvaus (pdf)
- Seminaariesitys 27.11.2020 (pdf)
Yksilöllinen fenotyyppidiagnostiikka keuhkosyöpäpotilaille
- Emmy Verschuren, Helsingin yliopisto
- Hankekuvaus (pdf)
- Seminaariesitys 27.11.2020 (pdf)
Johtoryhmä
Ohjelman johtoryhmän kokoonpano (toimikausi päättyy 31.12.2021):
- Markus Perola, biotieteiden, terveyden ja ympäristön tutkimuksen toimikunta (puheenjohtaja)
- Heli Peltola, biotieteiden, terveyden ja ympäristön tutkimuksen toimikunta
- Patrick Jern, kulttuurin ja yhteiskunnan tutkimuksen toimikunta
- Minnamari Vippola, luonnontieteiden ja tekniikan tutkimuksen toimikunta
- Riitta Julkunen-Tiitto, Itä-Suomen yliopisto
- Timo Otonkoski, Helsingin yliopisto
- Johanna Vilkki, Luonnonvarakeskus
Lisätietoja
- ohjelmapäällikkö Heikki Vilen, p. 029 533 5135
- ohjelmapäällikkö Sara Illman, p. 029 533 5119
- suunnittelija Tiina Neuvonen, p. 029 533 5076
Sähköpostiosoitteemme ovat muotoa etunimi.sukunimi(at)aka.fi