Duunia, duunia (31.1.2011 11:07)

Tutkijan työ on päässyt näyttämään parhaita puoliaan, kun artikkelien kirjoittaminen rullaa ja uusien laboratoriotilojen järjestely on sujunut hyvin. Viime aikoina uusien laboratoriotilojen järjestely on vaatinut paljon resursseja. Saimme laitoksemme remontin yhteydessä uuden tilan ympäristö molekyylibiologian tarpeisiin. Tähän asti tein työtäni Suomen ympäristökeskuksen kanssa yhteistyössä ja työskentelin heidän tiloissaan. Nyt on hienoa, kun käytössäni olevat tilat ovat helpot käyttää ja laitoksemme tarjoamat laitteistot ovat lähellä, mikä vähentää rakennusten välisen kulkemisen tarvetta.

Viime viikolla sain myös kuulla, että joulun alla FEMS Microbiology Ecology -lehteen hyväksytty artikkelini on viimein päätetty julkaista lehden maaliskuun numerossa. Kyseinen artikkeli käsittee metaania ravinnokseen kuluttavien bakteerien (metanotrofit) toiminnan ja bakteeriyhteisön monimuotoisuuden alueellista vaihtelua. Työ oli pitkäjänteinen ja vaati  paljon kärsivällisyyttä. Tutkimuksen näytteenotto tehtiin jo vuonna 2006 Siilinjärven Kevättömän järven rannalla, laboratoriotyöt tein kesällä 2007 Itävallassa ja kokeiden tuottaman datan analyysit kestivät syyskuulle 2010. 

Tulevina päivinä ja viikkoina minua työllistävät seuraavan metanotofien vuodenaikaisvaihtelua käsittelevän artikkelin viimeistely, luentojen valmistelu Biogeokemia -kurssille, ja laboratoriotyöt mikrosiruanalyysien (http://en.wikipedia.org/wiki/DNA_microarray) parissa. Väitöskirjaani sisältyy useita tutkimuksia liittyen järvenranta-alueiden metanotrofi yhteisöjen toimintaan ja monimuotoisuuteen. Valmistelen lähiviikkoina myös artikkeleita jotka käsittelevät lannoitetypen vaikutuksia ja vedenpinnan vaihtelun roolia metanotrofi yhteisöiden toiminnan säätelijöinä.