Huippuyksiköt 2006-2011

Vuosien 2006-2011 ohjelmassa on 23 huippuyksikköä. Akatemian rahoitus 2006-2011 on 63 miljoonaa euroa, Tekesin 4 miljoonaa euroa ja Nokian 600 000 euroa.

• Alitalo, Kari: Syövän biologian huippuyksikkö
• Astola, Jaakko: Signaalinkäsittelyn huippuyksikkö
• Bamford, Dennis: Virologian huippuyksikkö
• Frösén, Jaakko: Antiikin Kreikan kirjoitetut lähteet -huippuyksikkö
• Halonen, Lauri: Laskennallisen molekyylitutkimuksen huippuyksikkö
• Hanski, Ilkka: Metapopulaatiobiologian huippuyksikkö
• Hari, Riitta: Systeemisen neurotieteen ja aivokuvantamisen huippuyksikkö
• Hoikkala, Anneli: Evoluutiotutkimuksen huippuyksikkö
• Hupa, Mikko: Prosessikemian huippuyksikkö
• Julin, Rauno: Ydin- ja kiihdytinfysiikan huippuyksikkö
• Kallioniemi, Olli: Genomitiedon hyödyntämisen huippuyksikkö
• Kaprio, Jaakko: Kansantautien genetiikan tutkimuksen huippuyksikkö
• Kaski, Kimmo: Laskennallinen kompleksisten systeemien tutkimuksen huippuyksikkö
• Klabbers, Jan: Globaalin hallinnan tutkimuksen huippuyksikkö
• Nevalainen, Terttu: Englannin kielen vaihtelun, kontaktien ja muutoksen huippuyksikkö
• Nieminen, Risto: Laskennallisen nanotieteen huippuyksikkö
• Nikinmaa, Mikko: Evoluutiogenetiikan ja -fysiologian huippuyksikkö
• Nurmi, Jari-Erik: Oppimisen ja motivaation huippuyksikkö
• Oja, Erkki: Adaptiivisen informatiikan tutkimuksen huippuyksikkö
• Paalanen, Mikko: Matalien lämpötilojen kvantti-ilmiöiden ja komponenttien huippuyksikkö
• Palonen, Kari: Poliittinen ajattelu ja käsitemuutokset -huippuyksikkö
• Palva, Tapio: Kasvien signaloinnin tutkimuksen huippuyksikkö
• Päivärinta, Lassi: Inversio-ongelmien huippuyksikkö

Ohjelman yksikkökohtaisia rahoitustietoja löytyy Suomen Akatemian rahoituspäätöstilastoista hakuehdoilla Päätösvuosi: 2005, Haku: 2005 Huippuyksikköhaku 2006-2011 ja Päätösvuosi: 2008, Haku: 2008 Huippuyksikköohjelma 2006-2011, jatkorahoitus 2009-2011.