CAMPY

Konsortion johtaja: Professori Marja-Liisa Hänninen, Helsingin yliopisto, Elintarvike- ja ympäristöhygienian laitos (www.helsinki.fi)Hankkeen muut johtajat: 
Dosentti Hilpi Rautelin, Helsingin yliopisto, Haartman Instituutti (www.helsinki.fi)

Muut hankkeessa työskentelevät: 
LK Benjamin Feodoroff
FM Kerttu Valtanen
FM Elli Tervonen
DI Rauni Kärenlampi

HANKKEEN KUVAUS: 

Campylobacter jejuni ja coli ovat yleisimpiä suolistoinfektioiden aiheuttajia Suomessa. Vuosittain tapauksia esiintyy 3500 – 4000. Suurin osa tartunnoista saadaan ulkomaan matkan seurauksena, mutta merkittävä osa potilaista saa tartunnan kotimaassa erityisesti kesäaikaan. Suurin osa kotimaisista tautitapauksista ajoittuu heinä-syyskuun ajalle.  Tartunnat ovat suurimmaksi osaksi elintarvike- tai vesivälitteisiä. Kampylobakteerien taudinaiheuttamismekanismeista tiedetään vain vähän. Tarkoituksenamme on modernien menetelmien avulla tutkia kampylobakteerien taudinaiheuttamiskykyä, epidemiologiaa ja mikrobilääkeresistenssiä.

Tutkimuksessa analysoidaan kampylobakteeribakteerikantoja sekä potilaista että useista potentiaalisista tartuntalähteistä (eläimet, elintarvikkeet, vesi, linnut) n.14 vuoden ajalta (1996 - 2010. Tarkoituksenaon analysoida kampylobakteerien populaatiobiologiaa ja monimuotoisuutta käyttäen menetelmänä Multi-Locus-Sequence-Typing (MLST) tekniikkaa.  Tämän menetelmän avulla voidaan seurata eri reservuaareissa ja potilaiden kannoissa tapahtuneita/tapahtuvia muutoksia. Kantojen molekyyligenetiikkaa voidaan tarkemmin seurata pulssikenttäelektroforeesiin perustuvan tekniikan (PFGE) avulla. Kantojen virulenssiin liittyviä ominaisuuksia tutkitaan sekä geenispesifisillä menetelmillä että koko genomin analysointiin perustuvilla menetelmillä käyttäen uusinta tietoa saatavilla olevista genomeista. Kantojen adaptatoitumista eri isäntiin ja elintarvikkeisiin sekä adaptoitumisen mekanismeja tutkitaan genomitietoon ja proteomikkaan perustuvilla menetelmillä. Yhtenä spesifisenä, adaptoitumista selvittävänä tutkimuskohteena ovat mekanismit, joiden avulla kampylobakteerit muuttuvat antimikrobisille lääkeaineille resistenteiksi ja kehittävät multiresistenttejä populaatioita. Tutkimuksen avulla kehitetään uusia diagnostisia keinoja, joiden avulla saadaan tarkempi kuva eri isäntien merkityksestä taudin epidemiologiassa, kantojen virulenssista ja mekanismeista, jotka tuntemalla voidaan estää mikrobilääkeresistenssin syntymistä. 

Avainsanat:   Kampylobakteeri, taudinaiheuttamiskyky, epidemiologia, mikrobilääkeresistenssi