PATHOGENOMICS

ERA-NET PathoGenoMics –hankkeen (2004-2011) tavoitteena on edistää patogeenisten mikrobien genomitutkimusta. Sen budjetti EU:n 6. puiteohjelmasta on 3 miljoonaa euroa, josta Suomen Akatemian osuus on 270 000 euroa.  Mukana on keskeisiä tutkimusrahoitusorganisaatioita 10 maasta:

• Espanja (Ministry of Education and Science),
• Israel (Ministry of Health),
• Itävalta (Federal Ministry for Education, Science and Culture; Austrian Science Fund),
• Latvia (Latvian Council of Science),
• Portugali (Portuguese National Science Foundation),
• Ranska (Ministry of Research, Department for Bio-Engineering; Institut Pasteur; National Agency for Research),
• Saksa (Forschungszentrum Jülich GmbH,koordinaattori; Federal Ministry of Education and  Research),
• Slovenia (Ministry of Higher Education, Science and Technology),
• Suomi (Suomen Akatemia) ja
• Unkari (Hungarian Academy  of Science; Hungarian Scientific Research Fund).

Toimintaan osallistuu lisäksi organisaatiot kuudesta muusta maasta: Alankomaat (Netherlands Genomics Initiative), Iso-Britannia (Biotechnology and Biological Sciences Research Council, Wellcome Trust), Liettua (Ministry of Education and Science), Malta (Malta Council for Science and Technology), Norja (The Research Council of Norway )ja Ruotsi (Swedish Foundation for Strategic Research).

PathoGenoMics:n tutkimusalat ovat genomiikka (mm. rakenne ja funktionaalinen genomiikka, proteomiikka, bioinformatiikka), ihmiselle patogeeniset mikrobit (bakteerit, sienet) ja infektioiden molekyylibiologinen tausta (mm. virulenssitekijät sekä ihmisen ja mikrobin välinen vuorovaikutus).

PathoGenoMics luo perustaa yhteiseurooppalaiselle tutkimusohjelmalle. Tavoitteena on kansallisten tutkimusohjelmien tai ohjelman osien avulla kehittää alan rahoittajien välistä yhteistyötä ja rahoituskäytäntöjä, luoda alalle eurooppalaiset sisämarkkinat edistämällä tiedon, tutkijoiden, tekniikoiden ja resurssien liikkuvuutta sekä luoda alalle eurooppalaiset tutkimus- ja jatkokoulutusohjelmat.

Hankkeen aluksi kootaan tiedot alan tutkimusohjelmista Euroopassa ja sen ulkopuolella sekä poliittisten päättäjien ja alan johtavien tutkijoiden näkemykset keskeisistä yhteiskunnallisista ongelmista ja tutkimuksen painopistealueista koskien patogeenisten mikrobien genomitutkimusta tulevaisuudessa. Näiden avulla luodaan eurooppalaisen mikrobien genomitutkimusta koskevan tutkimusohjelman sisältö. Hankkeessa luodaan yhteiset hallinnolliset ja organisatoriset käytännöt yhteisrahoitteisia hakuja varten. Hauissa rahoitetaan vain kansainvälisiä tutkimuskonsortioita. Tutkijoiden valmistautumista hakuihin tuetaan työpajojen avulla. Hankkeessa välitetään tietoa patogeenisista mikrobeista ja niiden aiheuttamista taudeista yleistajuisessa muodossa suurelle yleisölle.

Suomen Akatemia on osallistunut hankkeeseen Mikrobit ja Ihminen -tutkimusohjelman (MICMAN) kautta.