Huippuyksiköt 2006-2011
Vuosien 2006-2011 ohjelmassa oli mukana 23 huippuyksikköä. Akatemian rahoitus 2006-2011 oli 63 miljoonaa euroa, Tekesin 4 miljoonaa euroa ja Nokian 600 000 euroa.
Ohjelman loppuarviointi alkaa vuonna 2012.
- Alitalo, Kari: Syövän biologian huippuyksikkö
- Astola, Jaakko: Signaalinkäsittelyn huippuyksikkö
- Bamford, Dennis: Virologian huippuyksikkö
- Frösén, Jaakko: Antiikin Kreikan kirjoitetut lähteet -huippuyksikkö
- Halonen, Lauri: Laskennallisen molekyylitutkimuksen huippuyksikkö
- Hanski, Ilkka: Metapopulaatiobiologian huippuyksikkö
- Hari, Riitta: Systeemisen neurotieteen ja aivokuvantamisen huippuyksikkö
- Hoikkala, Anneli: Evoluutiotutkimuksen huippuyksikkö
- Hupa, Mikko: Prosessikemian huippuyksikkö
- Julin, Rauno: Ydin- ja kiihdytinfysiikan huippuyksikkö
- Kallioniemi, Olli: Genomitiedon hyödyntämisen huippuyksikkö
- Kaprio, Jaakko: Kansantautien genetiikan tutkimuksen huippuyksikkö
- Kaski, Kimmo: Laskennallinen kompleksisten systeemien tutkimuksen huippuyksikkö
- Klabbers, Jan: Globaalin hallinnan tutkimuksen huippuyksikkö
- Nevalainen, Terttu: Englannin kielen vaihtelun, kontaktien ja muutoksen huippuyksikkö
- Nieminen, Risto: Laskennallisen nanotieteen huippuyksikkö
- Nikinmaa, Mikko: Evoluutiogenetiikan ja -fysiologian huippuyksikkö
- Nurmi, Jari-Erik: Oppimisen ja motivaation huippuyksikkö
- Oja, Erkki: Adaptiivisen informatiikan tutkimuksen huippuyksikkö
- Paalanen, Mikko: Matalien lämpötilojen kvantti-ilmiöiden ja komponenttien huippuyksikkö
- Palonen, Kari: Poliittinen ajattelu ja käsitemuutokset -huippuyksikkö
- Palva, Tapio: Kasvien signaloinnin tutkimuksen huippuyksikkö
- Päivärinta, Lassi: Inversio-ongelmien huippuyksikkö
Ohjelman yksikkökohtaisia rahoitustietoja löytyy Suomen Akatemian rahoituspäätöstilastoista hakuehdoilla Päätösvuosi: 2005, Haku: 2005 Huippuyksikköhaku 2006-2011 ja Päätösvuosi: 2008, Haku: 2008 Huippuyksikköohjelma 2006-2011, jatkorahoitus 2009-2011.