Huippuyksiköt 2002-2007
Vuosien 2002-2007 ohjelmassa oli 16 yksikköä. Akatemian rahoitus vuosina 2002-2007 oli 33,1 miljoonaa euroa ja Tekesin 5,3 miljoonaa euroa.
- Back, Ralph-Johan: Formaalit menetelmät ohjelmointitekniikassa
- Huhtaniemi, Ilpo: Miehen lisääntymisterveys
- Jacobs, Howard: Mitokondrioiden biogeneesin ja mitokondriotautien tutkimusyksikkö (FinMIT)
- Knuuttila, Seppo: Mielen historian tutkimusyksikkö
- Koskela, Erkki: Talouden rakenteet ja kasvu (RAKA)
- Kulmala, Markku: Ilmakehän koostumuksen ja ilmaston muutoksen fysiikka, kemia ja biologia
- Mattila, Pertti: Geometrinen analyysi ja matemaattinen fysiikka
- Näätänen, Risto: Helsingin aivotutkimuskeskus (HBRC)
- Pamilo, Pekka: Populaatiogeneettisten analyysien yksikkö
- Pekkanen, Juha: Ympäristöterveyden riskianalyysin huippuyksikkö
- Räisänen, Antti: Älykkäiden ja uusien radioiden tutkimusyksikkö (SMARAD)
- Seppälä, Jukka: Bio- ja nanopolymeerien tutkimusryhmä
- Sihvonen, Kaarina: Mikrobivarantojen tutkimusyksikkö
- Thesleff, Irma: Kehitysbiologian tutkimusohjelma
- Ukkonen, Esko: Datasta tietoon -tutkimusyksikkö
- Ylä-Herttuala, Seppo: Verisuonitautien ja tyyppi 2 diabeteksen tutkimusyksikkö
Ohjelman yksikkökohtaiset rahoitustiedot löytyvät Suomen Akatemian rahoituspäätöstilastoista hakuehdoilla Päätösvuosi: 2001, Haku: 2001 huippuyksikköhaku II kierros ja Päätösvuosi: 2004, Haku: 2004 Huippuyksikköjen jatkorahoitus.
Huippuyksikköohjelmista 2000-2005 ja 2002-2007 on tehty yhteiskunnallisuuden vaikuttavuuden arviointi. Arviointiraportti on julkaistu Akatemian julkaisusarjassa 1/09.